Beim Medizinischen Permanent Make-up wird, wie auch beim kosmetischen Permanent Make-up, Farbe durch das Feinstpigmentiergerät in die oberste Hautschicht eingebracht. Der signifikante Unterschied besteht lediglich in der Farbauswahl – denn bei der Medizinischen Pigmentierung werden eher aufhellende, Haut oder Brustwarzenähnliche Farben (Camouflage Farben) verwendet.